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IMP型金属β-内酰胺酶活性中心的计算机模拟分析

Computer simulation analysis on the IMP metallo-β-lactamase active center

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学术成果认领

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摘要应用信息论方法和计算机模拟的方法,对IMP型β-内酰胺酶序列及活性中心进行分析,结果表明在配体结合部位的大部分残基是高度保守的,但也有部分残基易发生变异,如32位Pro、31位Val和163位Try,这些变异是引起该酶不同变异型对β-内酰胺类抗生素水解能力不同的重要原因,在设计抑制剂时需考虑在酶高变区附近分子的柔性,以防出现新突变型而对昕设计抑制剂产生抗性.将酶和底物亚胺培南及青霉素G对接结果表明.底物与酶的结合自由能与酶的催化活性间有很好的相关性,可作为评估底物或酶抑制剂结合能力的重要评价指标.对接模型更细致地显示了酶中与底物相互作用的氨基酸残基,为酶抑制剂的合理设计奠定了基础.

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作者许岩 ^[1] 余江河 ^[1] 郑珩 ^[1] 劳兴珍 ^[1] 吕品一 ^[1] 学术成果认领

作者单位中国药科大学药物生物信息学教研室,南京,210009 ^[1]

关键词 IMP 金属β-内酰胺酶香农熵同源模建分子对接

主题词金属(Metals)计算机模拟(Computer Simulation)熵(Entropy)方法(Methods)才能(Aptitude)

分类号 R978.1+1

栏目名称 遗传育种与生物合成

发布时间 2009-11-20

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中国抗生素杂志

中国抗生素杂志

2009年34卷9期

543-547页

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