换一批ERIC-PCR与PFGE检测铜绿假单胞菌同源性的方法学比较
The methodology comparison of ERIC-PCR and PFGE used in Pseudomonas aeruginosa homology detection
摘要目的 比较肠杆菌基因间重复一致序列PCR(ERIC-PCR)与限制性内切酶联合脉冲场凝胶电泳(PFGE)检测铜绿假单胞菌同源性的方法学一致性.方法 分别用ERIC-PCR和PFGE对北京某医院48株铜绿假单胞菌株进行分型,明确其是否有克隆传播.结果 ERIC-PCR方法鉴定有34株为同一克隆来源,其余14株被分为9种基因型.PFGE方法分型鉴定有38株为同一克隆来源,其余10株表现为7种基因型,均提示脑外科内的铜绿假单胞菌在2010年存在一个克隆株传播.两种方法学结果的符合率为89.5％,PFGE重复3次结果相似度达96.6％,ERIC-PCR重复5次结果相似度达75.4％.结论 ERIC-PC操作简便快速,重复性较好,与PFGE结果一致性高,适合在基层医院进行细菌流行病学分析.
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