广西北仑河口红树林植物根际土壤放线菌多样性及抗菌活性研究

Diversity and antimicrobial activity of actinobacteria isolated from mangrove rhizosphere soil in Beilun Estuary, Guangxi

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摘要目的勘探广西北仑河口红树林植物根际土壤放线菌资源多样性并进行抗菌活性研究,为新抗生素发现提供药用放线菌资源.方法采用5种分离培养基,以稀释涂布法分离放线菌;通过PCR扩增获得菌株16S rRNA基因并进行同源性比对,分析放线菌多样性;发酵液经乙酸乙酯萃取,菌丝经丙酮浸泡,分别获得发酵液水相、发酵液酯相和菌丝丙酮浸提液3类样品;纸片扩散法进行抗菌活性测试;PCR技术探测抗菌活性菌株是否存在PKS Ⅰ、PKS Ⅱ及NRPS生物合成基因.结果从7份红树林植物根际土壤样品中分离纯化得到110株放线菌,分布于7个目9个科15个属,优势菌属为小单孢菌属和链霉菌属;菌株N04M112、3804M13、Z05M23和Z07M34的16S rRNA基因序列与有效发表菌株Agromyces humatus CD5T(AY618216)、Streptomyces atrovirens NRRLB-1635U(DQ026672)、Streptosporangium jomthongense 30EHST(JQ922513)和Micromonospora wenchangensis 2602GPT1-05T(JQ768361)的相似率最高,分别为97.49％、98.42％、98.58％和98.54％,可能为潜在新物种;抗菌活性检测结果表明,51株放线菌中,46株有抗菌活性,总阳性率为90.20％;对这46株放线菌的抗生素生物合成基因探测发现,10株同时具有PKS Ⅰ、PKS Ⅱ及NRPS生物合成基因,42株至少含有其中1种,总阳性率91.30％.结论广西北仑河口红树林植物根际土壤中含有较为丰富的放线菌资源,具有从中发现放线菌新物种和新抗生素的潜力.