换一批
换一批摘要为快速鉴定噬菌体的结构蛋白,并且发现具有新功能的蛋白,为噬菌体功能的研究提供基础.本研究用临床分离到的屎肠球菌为指示菌,从医院污水中分离到1株裂解性噬菌体,命名为vB_EfaP_IME 199.对噬菌体大量培养、浓缩和纯化,然后进行蛋白质组学分析、全基因组测序,进化分析,确定该噬菌体为短尾噬菌体科,全基因组序列长为18839bp,GC含量为34.6％.在线注释预测该噬菌体基因组功能基因,注释出22个ORFs,其中11个ORFs为假想蛋白序列,其余11个ORFs的功能已知.采用质谱技术对浓缩纯化的噬菌体进行蛋白质组分析,共鉴定出11个蛋白质,其中有6个蛋白为功能已知的结构蛋白,其余为假想蛋白.本实验利用蛋白质组技术快速有效的鉴定出噬菌体的结构蛋白,建立了一种噬菌体蛋白的分析方法,为该噬菌体的基因功能研究提供了基础.
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栏目名称
噬菌体专辑
DOI
10.3969/j.issn.1001-8689.2017.09.008
发布时间
2017-11-07
基金项目
科技重大专项“十二五”实施计划项目
国家高技术研究发展计划项目(863计划)
国家自然科学基金项目
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