湖州市某三甲医院住院患者艰难梭菌毒素基因检测及其分子流行病学分析
Toxin gene detection and molecular epidemiology of Clostridioides difficile isolated from hospitalized patients in a tertiary hospital in Huzhou
摘要目的 研究地市级医院住院患者艰难梭菌感染的发生情况,并分析艰难梭菌的分子流行病学特征.方法 收集湖州市第一人民医院2023年11月—2023年12月住院腹泻患者粪便标本,培养分离艰难梭菌后,采用核酸扩增技术检测毒素基因,菌株经全基因测序后(Whole Genome Sequencing,WGS)进行分子流行病学分析.结果 从500份住院患者腹泻样本中分离得到49株艰难梭菌,其中产毒型艰难梭菌40株,艰难梭菌感染(Clostridium difficile infections,CDI)阳性率为8.00%;PCR检测的毒素基因主要为tcdA(+)/tcdB(+),双毒素基因阴性(A+B+CDT-),占97.50%(39/40),1株携带双毒素基因(A+B+CDT+);CDI阳性率最高的科室是消化内科,其次为ICU;MLST分型中,共有13种ST型别,其中ST2型为优势型别,占30.00%;结合WGS数据分析,未发现艰难梭菌菌株在研究期间发生流行和传播.结论 本院CDI在住院腹泻患者中的发生率较低,未发生院内感染传播和暴发流行现象,但不排除存在未知感染源可能性,应重点关注重点科室,如ICU患者发生CDI情况.
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