换一批摘要相较于常用的Pearson检验,Cochran-Armitage趋势检验(CAT检验)由于整合了遗传模式的信息,具有更高的功效.然而在实际应用中,真实的遗传模式通常未知,使用错误模式对应的CAT检验可能会显著降低检验功效.因此,对于遗传模式稳健且具有较高功效的检验方法的开发尤为重要.MAX型检验将不同遗传模式对应的CAT检验统计量取最大值作为检验统计量,具有稳健有效性.然而MAX型检验在原假设下的分布十分复杂,尽管可以通过大样本近似或置换方法获得,但前者的准确性受制于样本量大小,后者因其对重复模拟的需求而表现出相对较低的计算效率.为解决这一问题,本文提出了一种基于组合计数方法计算MAX型检验精确p值的新方法.模拟结果显示,我们提出的精确方法相比大样本近似方法更为准确,并且在计算效率上优于置换方法.计算的高效性和准确性使得该方法可扩展至大规模的全基因组关联分析.另外,我们还开发了相应的R程序包,该程序包可通过https://github.com/Myuan2019/MaXact/获取.
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