基于生物信息学分析PRDM家族在甲状腺癌中的表达及临床意义

二维码有效期 120s

摘要目的探讨PRD-BF1 和RIZ同源结构域蛋白(PRDM)家族在甲状腺癌中的表达及与甲状腺癌患者预后的关系,对部分家族成员在甲状腺癌中的作用机制进行初步分析.方法运用UALCAN数据库分析PRDM家族在甲状腺癌中的表达;UALCAN数据库分析PRDM家族与甲状腺癌预后的关系;StarBase和HMDD数据库分析与PRDM家族成员相互作用的上游miRNA;StarBase数据库分析与PRDM家族成员相互作用的下游靶基因;DAVID数据库对PRDM家族成员相互作用的下游靶基因进行生物学功能注释.结果 PRDM1、PRDM3 在甲状腺癌组织中表达水平明显高于正常组织(P<0.05).PRDM2、PRDM4、PRDM5、PRDM6、PRDM8、PRDM10、PRDM11、PRDM15、PRDM16 在甲状腺癌组织中表达水平明显低于正常组织(P<0.05).PRDM6、PRDM11、PRDM12、PRDM16 与甲状腺癌的患者预后高度相关(P<0.05).在甲状腺癌中与PRDM6 相关并具有统计学意义的miRNA为hsa-miR-20a-5p、hsa-miR-625-5p(P<0.05).对与PRDM6 相关的下游靶基因预测并进行生物学功能注释,PRDM6 可通过与靶基因的作用参与DNA损伤修复等生物学过程.结论 PRDM家族的表达与甲状腺癌相关,部分家族成员的表达与甲状腺癌预后及临床病理特征密切相关.PRDM家族成员PRDM6 可通过与上游miRNA及下游靶基因的相互作用,参与甲状腺癌的发生发展.PRDM家族,特别是PRDM6,可能成为甲状腺癌诊治的新靶点.