采用荧光定量PCR溶解曲线法监测人TCR alpha链CDR3谱系漂移技术的初步探讨

Establishment of the technique for the real-time fluorescence quantitative reverse transcription polymerase chain reaction by DNA melting curve analysis for detecting the CDR3 skewing of TCR alpha gene repertoire in the human peripheral blood

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摘要目的:初步探讨荧光定量PCR溶解曲线分析技术监测人外周血T细胞TCR alpha链CDR3谱系漂移(单/寡/多克隆增生).方法:提取4例正常人、2例淋巴瘤型白血病患者PBMC中的总RNA,逆转录成cDNA,以32个人TCR alpha 链胚系可变区基因家族 (TRAV)设计上游引物,共同的TCR alpha 胚系链恒定区基因家族(TRAC)设计下游引物,荧光定量PCR(FQ-PCR)扩增32个TRAV基因各家族CDR3谱系,溶解曲线法分析各家族CDR3谱系的单/寡/多克隆增生.结果:正常人外周血T细胞TCR alpha链32个家族CDR3表达频率不一致,各家族PCR产物的溶解曲线谱型图(melting curve spectratyping)呈现熔点不同的CDR3多态性,为多克隆增生的高斯分布,2例淋巴瘤型白血病患者外周血T细胞TCR alpha链32个家族CDR3表达频率不一致,部分家族呈缺失状态,患者各家族PCR产物的溶解曲线谱型图上,多数家族为多克隆增生的高斯分布,但每个患者均出现数量不等的单克隆和寡克隆增生家族.结论:荧光定量PCR溶解曲线分析TCR alpha链CDR3谱系漂移技术方法稳定简便,能较好地监测正常人和临床样本外周血T细胞TCR alpha链CDR3谱系漂移(单/寡/多克隆增生).