H7 N9流感病毒HA、NA蛋白的抗原表位预测及其与HLA-Ⅱ类等位基因的相关性分析
Prediction of antigenic epitopes on HA, NA amino acid sequences of novel influenza A (H7N9) virus and analysis association between susceptibility and HLA-Ⅱalleles
摘要目的:分析H7N9流感病毒的HA、NA蛋白的抗原表位;预测H7N9流感病毒相关的HLA-Ⅱ类等位基因及易感人群。方法:软件分析HA、NA的同源性、B细胞表位、T细胞表位以及与HA、NA结合力强的HLA-Ⅱ类等位基因;并根据该等位基因在亚洲不同地域的基因频率,预测H7N9的易感人群。结果:H7N9流感病毒株之间氨基酸序列相对保守;HA具有10个B细胞表位和15个T细胞表位;NA有12个B细胞表位和9个T细胞表位;HLA等位基因DRB1*0701与HA、NA具有强结合力,在新疆、哈尔滨、山东、辽宁、北京、石家庄、天津等多个中国北方地区人群中的基因频率较高,高于广东、云南、台湾地区、日本和韩国。结论:预测了HA、NA的抗原性表位,为H7 N9流感病毒的疫苗研究提供了理论基础;HLA-DRB1*0701与H7 N9流感病毒高度相关;H7 N9流感病毒在新疆、哈尔滨、山东、辽宁、北京、石家庄、天津地区更易传播。
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