换一批欧洲女贞花粉主要过敏原Ligv1理化性质与结构的生物信息学分析
In silico prediction for physicochemical properties and structure of major pollen allergen Lig v 1 in Ligustrum vulgare
摘要目的：运用生物信息学相关软件，预测欧洲女贞花粉主要过敏原Ligv1的理化性质和结构，为Ligv1重组表达系统的选择和过敏原性改造提供参考。方法：查询文献获得Ligv1的氨基酸序列，运用生物信息学软件分析其理化性质（ProtParam）、信号肽（SignalP 4.1 Server）、跨膜区（TMHMM Server v.2.0）、二级结构（GOR4）、MHCⅡ类抗原表位（NetMHCⅡ2.2 Server）、B 细胞抗原表位（ProteanTM 5.01）以及系统发生树（MEGA 6）。结果：Ligv1在大肠杆菌中稳定性较好，不存在信号肽与跨膜区；二级结构中无规则卷曲占大多数；Ligv1潜在MHCⅡ类抗原表位为30～44区域；B 细胞抗原表位既具有连续的氨基酸序列，也具有不连续的氨基酸序列；Ligv1与欧洲白蜡以及木犀榄的同源蛋白进化距离最近。结论：大肠杆菌是适合重组Ligv1的表达系统，Ligv1抗原表位分析为低过敏原性改造提供参考。
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分类号
R392.8（医学免疫学）
栏目名称
DOI
10.3969/j.issn.1000-484X.2016.09.010
发布时间
2016-09-29（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
国家科技重大专项（2014ZX0801105B）
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