换一批基于GEO数据库分析高血压肾病的差异表达基因及免疫细胞浸润
Analysis of differentially expressed genes and immune cell infiltration in hypertensive nephropathy based on GEO database
摘要目的:分析高血压肾病(HN)差异表达基因(DEGs)及免疫细胞浸润模式.方法:从GEO数据库中下载HN和健康人肾小管间质组织样本基因芯片数据集,使用R软件分析得到DEGs,并利用Metascape在线分析平台进行DEGs的功能富集分析,通过LASSO、SVM-RFE和RF三种机器学习算法筛选特征基因并验证诊断价值,最后利用CIBERSORT算法进行免疫细胞浸润分析.结果:共获得277个DEGs,功能富集分析发现其与先天免疫反应、体液免疫反应、对细胞因子的反应等多种免疫相关过程有关.机器学习算法共获得3个特征基因,分别为CISH、GADD45A和ZFP36,均具有良好的诊断价值,免疫细胞浸润分析发现调节性T细胞和M1巨噬细胞浸润较多,并且多种免疫细胞之间具有相关性.结论:HN的发病机制可能与多种免疫相关过程有关,调节性T细胞和M1巨噬细胞可能在HN的发病机制中发挥关键作用,CISH、GADD45A和ZFP36是HN潜在的诊断标志物.
更多相关知识
关键词
高血压肾病差异表达基因机器学习算法诊断标志物免疫细胞浸润Hypertensive nephropathyDifferentially expressed genesMachine learning algorithmsDiagnostic markersImmune cell infiltration
栏目名称
DOI
10.3969/j.issn.1000-484X.2024.02.003
发布时间
2024-04-12（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
- 浏览76
- 被引3
- 下载15
相似文献
- 中文期刊
- 外文期刊
- 学位论文
- 会议论文
