换一批胶原诱导性关节炎大鼠血浆tRF和tiRNA的差异表达及功能分析
Differential expression and functional analysis of plasma tRF and tiRNA in collagen-induced arthritis rats
摘要目的:探究胶原诱导性关节炎(CIA)大鼠血浆转运RNA衍生片段(tRF)和转运RNA半分子(tiRNA)的差异表达,并对其靶基因进行生物学功能及通路的富集分析,为类风湿关节炎(RA)的诊断和治疗寻找新的靶点.方法:皮下注射Ⅱ型胶原建立RA大鼠模型,通过关节炎指数(AI)积分、HE染色评价疾病模型;利用Illumina平台测序获取tRF和tiRNA表达谱,RT-qPCR用于tRF和tiRNA表达量的验证;结合miRanda和TargetScan数据库预测差异表达tRF和tiRNA的靶基因;GO和KEGG富集分析对靶基因功能进行注释.结果:CIA模型大鼠血浆共有25个差异表达的tRFs和tiRNAs,其中23个上调,2个下调;筛选出6个CIA大鼠特异性表达tRFs和tiRNAs,分别为Other-36:73-tRNA-Arg-CCT-4、Other-57:70-tRNA-Glu-CTC-1-M3、tRF-1:32-Gly-CCC-1-M2、tRF-1:31-Gly-CCC-1-M2、tRF-1:32-Pro-AGG-1-M4和tRF-1:32-Glu-TTC-2-M2,其靶基因GO分析主要涉及细胞器相关条目,KEGG分析富集到多条与RA相关的经典信号通路.结论:差异表达tRFs和tiRNAs的靶基因可能参与调控RA的重要病理生理过程及药物治疗的作用靶点.
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关键词
类风湿关节炎胶原诱导性关节炎转运RNA衍生片段转运RNA半分子Rheumatoid arthritisCollagen-induced arthritistRNA-derived RNA fragmenttRNA halves
分类号
R593.2（全身性疾病）
栏目名称
DOI
10.3969/j.issn.1000-484X.2025.05.004
发布时间
2025-05-22（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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