换一批基于细胞衰老相关基因构建胃腺癌预后模型及免疫微环境分析
Construction of a prognostic model for gastric adenocarcinoma based on cellular senescence-related genes and analysis of immune microenvironment
摘要目的:利用生物信息学方法构建胃腺癌细胞衰老相关预后模型并进行免疫微环境分析.方法:从TCGA数据库中下载胃腺癌患者的基因表达数据及对应的临床信息,从CellAge数据库中下载细胞衰老相关基因(CSRGs);在R软件中利用limma包筛选胃腺癌组织中差异表达的CSRGs,利用survival包筛选影响胃腺癌患者预后的CSRGs;利用LASSO回归分析构建胃腺癌风险模型,并计算每个患者的风险得分;利用Kaplan-Meier生存分析比较高低风险组患者的总体生存期(OS);通过受试者工作特征(ROC)曲线分析预后模型预测患者五年生存率的有效性;使用单因素和多因素Cox回归分析筛选胃腺癌患者的独立预后因素;利用基因富集分析(GSEA)预测高低风险组患者潜在的信号通路;基于ESTIMATE和单样本基因集富集分析(ssGSEA)算法分析高低风险组患者肿瘤免疫微环境差异.结果:筛选出16个预后相关的差异表达CSRGs.LASSO回归分析构建了含有AGT、EZH2、NOX4和ZFP36基因的预后模型,并根据风险得分中位值将患者分为高低风险两组.生存分析显示高风险组患者OS显著低于低风险组患者.ROC曲线显示预后模型能够较准确预测患者五年生存率(AUC=0.703).多因素Cox回归分析显示年龄和风险得分是胃腺癌患者的独立预后因素.GSEA富集分析显示高风险组与上皮间充质转换、缺氧、血管生成等信号通路相关,而低风险组与G2M检查点、DNA修复、过氧化物酶体等信号通路相关.进一步分析显示,高风险组患者免疫细胞浸润丰度更高,免疫检查点相关基因表达水平更高.结论:本研究构建了一个新的胃腺癌细胞衰老相关预后模型,其中高风险组患者有着更高的免疫活性.
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关键词
胃腺癌细胞衰老预后模型免疫微环境Gastric adenocarcinomaCellular senescencePrognostic modelImmune microenvironment
分类号
R735.2（消化系肿瘤）
栏目名称
DOI
10.3969/j.issn.1000-484X.2025.06.029
发布时间
2025-06-26（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
中国博士后科研资助项目（2020M671278）
常州市科技项目（CJ20220130）
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