换一批系统性红斑狼疮中与铁代谢相关诊断标志物的筛选与验证
Screening and validation of diagnostic markers related to iron metabolism in systemic lupus erythematosus
摘要目的:筛选系统性红斑狼疮(SLE)中铁代谢相关诊断标志物,探讨免疫细胞的浸润情况及circRNA-miRNA-mRNA调控网络.方法:将3个数据集合并形成原始数据集.筛选差异表达基因(DEGs),并进行功能富集分析.随后使用加权基因共表达网络分析(WGCNA)和用LASSO回归机器学习筛选诊断标志物基因.利用CIBERSORT算法进行免疫浸润分析.通过收集SLE的外周血样本进行qPCR验证,以及利用2个独立数据集验证诊断标志物对SLE的诊断能力.最后通过miRNet与HMDD数据库预测SLE相关的miRNAs,通过circbank和circRNA Disease数据库预测SLE相关的circRNAs,利用Cy-toscape软件构建cirRNA-miRNA-mRNA调控网络.结果:共鉴定出448个DEGs,其中292个上调,156个下调.通过WGCNA分析和LASSO回归机器学习共获得2个诊断标志物.CIBERSORT分析显示,SLE中多种免疫细胞浸润比例与正常对照相比存在差异,2个诊断标志物的表达水平与SLE中多种免疫细胞相关.qPCR结果表明,2个基因的表达水平相对于正常对照显著升高,原始和外部数据集中的ROC曲线表明,2个诊断标志物对SLE具有较强的诊断能力(AUC>70%).最后构建的circRNA-miRNA-mRNA网络由6个circRNAs、18个miRNAs和2个mRNAs组成.结论:最终确定2个诊断标志物,分别为RSAD2和BLVRA,可能通过6个circRNAs、18个miRNAs介导成为未来诊断和治疗SLE的分子靶点.
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关键词
系统性红斑狼疮诊断标志物免疫浸润生物信息学机器学习Systemic lupus erythematosusDiagnostic markersImmunoinfiltrationBioinformaticsMachine learning
分类号
R593.24+1（全身性疾病）
栏目名称
DOI
10.3969/j.issn.1000-484X.2026.01.024
发布时间
2026-01-29（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
西安市卫生健康委员会科研项目（2024yb10）
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