基于生物信息学和实验验证柴胡-白芍药对治疗抑郁症的作用机制
Validating mechanism of action of Radix Bupleuri-Radix Paeoniae Alba in treatment of depression based on bioinformatics and experimental
摘要目的:基于生物信息学、分子对接和动物实验,探究柴胡-白芍药对治疗抑郁症的作用机制.方法:综合生物信息学方法筛选柴胡-白芍药对治疗抑郁症的潜在作用靶点,进行GO生物过程和KEGG通路富集分析,采用Cytoscape结合机器学习算法进一步筛选核心基因,通过分子对接和动物实验进行验证.结果:共获得96个柴胡-白芍药对治疗抑郁症的潜在靶点,KEGG通路富集分析发现柴胡-白芍药对治疗抑郁症可能与HIF-1信号通路、PI3K/AKT信号通路、Th17细胞分化等有关;Cytoscape软件结合随机森林(RF)和Lasso算法进一步筛选获得HSP90AB1、MAPK14、MMP9和PIK3R1 4个核心靶点,分别与4种核心成分:山萘酚、异鼠李素、矮牵牛素、槲皮素进行分子对接,结果显示:这4种核心成分分别与HSP90AB1、MAPK14、MMP9的结合能均小于-7 kcal/mol.通过构建慢性不可预知轻度应激(CUMS)大鼠抑郁模型,显示柴胡-白芍药对可显著增加旷场实验中大鼠的运动速度和进入中心区的次数,提高大鼠的蔗糖偏好度,缩短大鼠强迫游泳不动时间;qPCR结果表明柴胡-白芍药对可下调海马组织MAPK14、MMP9表达(P<0.05)、上调HSP90AB1 mRNA表达(P<0.05),同时降低RORγt、提高Foxp3 mRNA表达(P<0.05).结论:柴胡-白芍药对的核心成分山萘酚、异鼠李素、矮牵牛素和槲皮素可通过调节HSP90AB1、MAPK14和MMP9等核心靶点影响Th17细胞分化,发挥治疗抑郁症的药理作用.
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