基于微卫星标记的绿背山雀遗传结构分析

Microsatellites underestimate genetic divergence in the Green-backed Tit (Parus monticolus)

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摘要近些年来,核序列基因和微卫星标记被广泛地应用于物种遗传结构分析,然而,对于两者的有效性我们却知之甚少.本文以绿背山雀(Parus monticolus)为研究对象,探讨核序列基因和微卫星标记在解析物种遗传结构方面的有效性.绿背山雀中部和西南线粒体谱系分支在核序列基因上存在相应的遗传分化,而在微卫星数据上却不存在分化.两个谱系分支在核序列基因上的FST值是微卫星的4倍.我们认为等位基因大小异源同形(size homoplasy)可能是导致微卫星标记无法区分两个谱系分支的主要原因.我们的研究结果表明在探讨物种遗传结构,且当目标种群具有较大的有效种群数量时,核序列基因比微卫星标记具有更强的适用性.绿背山雀各线粒体谱系分支间的FST值与等位基因数量不存在显著的相关性,该结果表明微卫星标记的有效性与等位基因的数量无关.RST值的变化范围比FST值大,因此更不利于探讨种群间的遗传分化.与核序列基因相符,微卫星标记同样揭示了台湾支系的遗传独立性.台湾支系与大陆支系间的遗传分化可能属于严格的异域分化过程.

作者王文娟 ^[1] 戴传银 ^[2] Bailey D.MCKAY ^[3] 赵娜 ^[4] 李寿先 ^[5] 雷富民 ^[6] 学术成果认领

作者单位动物进化与系统学院重点实验室,中国科学院动物研究所,北京,100101;中国科学院大学,北京,100049 ^[1] 动物进化与系统学院重点实验室,中国科学院动物研究所,北京,100101;贵州师范学院化学与生命科学学院,贵阳,550018 ^[2] 美国自然历史博物馆 ^[3] 水利部水工程生态效应与生态修复重点实验室,水利部中国科学院水工程生态研究所,武汉,430079 ^[4] 台湾师范大学生命科学学院 ^[5] 动物进化与系统学院重点实验室,中国科学院动物研究所,北京,100101 ^[6]

关键词遗传结构微卫星绿背山雀核序列基因等位基因大小异源同形 genetic structure microsatellite Parus monticolus sequence-based nuclear data size homoplasy

主题词遗传结构(Genetic Structures)基因(Genes)等位基因(Alleles)性(Sex)遗传(Heredity)

栏目名称 ORIGINAL ARTICLE

DOI 10.5122/cbirds.2013.0017

发布时间 2013-08-08

基金项目

This study was supported by the National Science Fund for Distinguished Young Scientists the Major International (Regional) Joint Research Project the CAS-IOZ Innovation Program by a grant (No.O529YX5105) from the Key Laboratory of the Zoological Systematics and Evolution of the Chinese Academy of Sciences to F.M.Lei

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