外排泵抑制剂CCCP对阿奇霉素外排阳性耐药痤疮丙酸杆菌的影响
Effect of Efflux Pump Inhibitor CCCP on Drug-Resistant Cutibacterium Acnes Positive for Azithromycin Efflux Pump Phenotype
摘要目的 挖掘痤疮丙酸杆菌外排泵耐药相关基因及通路.方法 对阿奇霉素外排表型阳性的耐药痤疮丙酸杆菌,使用外排泵抑制剂羰基氰氯苯腙(CCCP)处理,分别提取处理前后的痤疮丙酸杆菌总RNA进行转录组测序与基因本体(GO)、基因组百科全书(KEGG)分析.结果 转录组测序中共发现755条差异表达基因.其中下调表达427条(56.56%),在GO数据库中注释到250个,在KEGG数据库中注释到182个,上调表达的基因有328条(43.44%),在GO数据库中注释到266个,在KEGG数据库中注释到236个.KEGG分析中下调表达基因富集最显著的通路为ABC转运蛋白通路,此通路共55个基因,差异表达基因含有27个,其中下调的前十个基因为:gtsC、ngcF、cycB、cebF、ngcE、gtsB、gtsA、oppB、oppA、ecfT.结论 CCCP对阿奇霉素外排阳性耐药痤疮丙酸杆菌的影响,主要以下调基因表达为主,且下调表达基因中以ABC转运蛋白通路最为显著,推测痤疮丙酸杆菌外排泵耐药与该通路及相关基因有密切关系.
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