换一批北京地区宋内志贺菌分子流行病学特征分析
Molecular epidemiological characteristics of Shigella Sonnei isolates in Beijing
摘要目的 了解北京地区宋内志贺菌毒力基因分布及分子流行病学特征. 方法 采用实时荧光PCR方法检测毒力基因、脉冲场凝胶电泳(PFGE)分型,多位点序列分型(MLST)及多位点可变数目串联重复序列分析(MLVA)等方法对北京地区2001～2009年50株志贺菌菌株进行分子流行病学特征分析. 结果 50株菌中,ipaH、set1、sen三种毒力基因的携带率分别为98％,18％和78％.选取19株流行病学和遗传背景无关的菌株,进行MLST、MLVA与PFGE分型方法的比较,MLST为1个序列型ST152 complex:adk(11)、fumC (63)、gyrB(7)、icd(1)、mdh(14)、purA (7)、recA(7); MLVA被分成15个型别,D值为0.9708;PFGE分成12个型别,D值为0.9532.MLVA初筛得到的8个可变数目串联重复(VNTR)位点用于扩大菌株分析,发现50株志贺菌被分为21个MLVA的型别,TS002和TS001为主要型别. 结论 北京地区近年来流行的宋内志贺菌存在毒力基因的丢失,MLVA分子型别复杂,存在多克隆来源,提示需要进行连续系统的分子流行病学监测.
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关键词
宋内志贺菌分子分型多位点序列分型多位点可变数目串联重复分析Shigella sonneiMolecular subtypingMultilocus sequence Subtyping (MLST)Multilocus variable-number tandem-repeat analysis(MLVA)
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2013-10-22（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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