重组酶介导扩增联合双重核酸侧流层析试纸条法快速检测金黄色葡萄球菌及mecA耐药基因
Rapid detection of Staphylococcus aureus and mecA gene by recombinase aided amplification combined with dual nucleic acid lateral flow strips
摘要目的 为缩短金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus,SA)检测时间,本研究建立一种基于重组酶介导扩增(recombinase aided amplification,RAA)联合双重核酸侧流层析试纸条法(lateral flow strips,LFS)快速检测SA耐热核酸酶nuc基因和mecA耐药基因.方法 在SA基因组中nuc基因和mecA基因的保守序列上设计并筛选高效的RAA引物和探针,验证RAA-LFS同时检测nuc基因和mecA基因的反应温度和时间,进行灵敏度、特异度以及与荧光定量聚合酶链反应(quantitative real-time polymerase chain reaction,qPCR)比较,采用2家三甲医院的52瓶非重复阳性血培养进行前瞻性评价.结果 RAA-LFS在20~45℃下反应15~30 min可同时扩增nuc和mecA基因,检测下限可达102 CFU/mL,50株临床分离的非SA菌株验证nuc和mecA基因的特异度为100%;本实验室保存的30株耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(methicillin-resistant Staphylococcus aureus,MRSA)和30株甲氧西林敏感金黄色葡萄球菌(methicillin-sensi-tive Staphylococcus aureus,MSSA)nuc基因均阳性,mecA基因共有30株阳性,与qPCR的检测阳性符合率和阴性符合率均为100%,一致性检验Kappa值为1;在52瓶阳性血培养前瞻性分析中,16株MSSA和6株MRSA与梅里埃VITEK-2 compact微生物检测系统的鉴定和药敏试验检测结果符合率100%.结论 本研究将核酸释放剂、RAA、核酸侧流层析试纸条法3项技术组合建立了一种可应用于菌落或阳性血培养瓶检测SA及mecA耐药基因,操作简便、快速、敏感性高的检测方法.
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