长沙市2例本地发热伴血小板减少综合征病例流行病学调查及基因特征
Epidemiological investigation and genetic characteristics of two local cases of fever with thrombocytopenia syndrome in Changsha
摘要目的 调查长沙市2例本地发热伴血小板减少综合征(severe fever with thrombocytopenia syndrome,SFTS)病例流行病学特征,分析大别班达病毒(Dabie bandavirus,DBV)的分子遗传特性,为本地疫情监测和防控提供科学依据.方法 采集2例SFTS病例和密切接触者的血液样本及其生活环境周边动物血清及蜱虫标本.采用荧光定量逆转录聚合酶链反应(reverse transcription polymerase chain reaction,RT-PCR)法检测DBV核酸,对阳性样本使用Illumi-na测序平台进行全基因组测序,通过CLC Genomics Workbench 25.0软件完成序列拼接,从GenBank数据库下载与本研究相似度较高的序列,应用DNA STAR及MEGA 7.0等生物信息软件分析基因序列同源性、氨基酸变异及构建系统发育树.结果 2例长沙SFTS病例DBV核酸均为阳性,其L、M、S基因片段核苷酸同源性>99.8%,与GenBank数据库参考序列同源性分别为95.9%~99.6%(L),93.7%~99.8%(M),95.6%~99.8%(S).其中与山东株QD04同源性最高(99.6%~99.8%).遗传进化分析显示,2例病例标本的L、M、S基因均属于基因型B.氨基酸分析发现糖蛋白(glyco-protein,GPs)存在特异性突变位点(GPs-501T、662P、962S),可能与病毒致病性相关.结论 长沙市2例本地DBV流行株与山东株高度同源,但存在独特的氨基酸变异,可能影响病毒传播能力,需加强长沙市蜱媒与动物宿主监测和多途径传播机制的研究.
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