云南省玉溪市鼠类感染巴尔通体调查及系统进化分析
Investigation and phylogenetic analysis of Bartonella infection in rodents in Yuxi,Yunnan Province
摘要目的 初步了解云南省玉溪市鼠类中巴尔通体的感染情况,为玉溪市巴尔通体的综合防控提供科学依据.方法 2024年在玉溪市8个县(市、区)区进行样本采集,利用荧光聚合酶链反应(polymerase chain reaction,PCR)方法确定样本巴尔通体是否阳性;选取Ct值小于30的样本,运用PCR方法扩增rpoB基因片段;通过Sanger测序测定扩增的rpoB基因片段序列,进行相似度比对并采用邻接法构建系统进化树,对测定序列进行系统进化分析.结果 共采集到215只鼠类的脏器组织样本215份,分别来自2属5种啮齿动物,褐家鼠为优势种(74.42%,160/215).这些动物组织样本中巴尔通体总体阳性率为30.23%(65/215);其中,小家鼠样本阳性率为30.00%(3/10),黄胸鼠样本阳性率为26.19%(11/42),褐家鼠样本阳性率为31.25%(50/160),小家鼠、黄胸鼠、褐家鼠阳性率的差异无统计学意义(χ2=0.404,P>0.05).8个县(市、区)均检测出巴尔通体阳性,不同地区阳性率差异有统计学意义(χ2=23.088,P<0.01),华宁县阳性率最高,为60.00%(18/30),澄江市阳性率最低,为13.33%(6/45).对选取的19份Ct值小于30的阳性样本进行rpoB基因扩增并测定,经序列比对分析,共检测出4种巴尔通体,分别是特利波契巴尔通体(Bartonella tribocorum)10株,伊丽莎白巴尔通体(Bartonella elizabathae)2株,菲西巴尔通体(Bartonella phoceensis)1株,未定种巴尔通体6株.结论 玉溪市鼠类中至少存在4种巴尔通体,其中特利波契巴尔通体为主要流行菌种.
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