换一批
换一批幽门螺杆菌中国株cagA全长基因克隆及其分子特征分析
Cloning of the full length cagA gene of Helicobacter pylori isolated in China and analysis of its molecular characteristics
摘要目的 克隆幽门螺杆菌中国株MEL-Hp 27 cagA全长基因,并进行分子特征分析.方法 参考Hp26695基因组序列,分别针对cagA基因编码区保守序列和位于cagA基因上、下游的基因序列设计两对PCR引物,交叉分段扩增包括cagA基因编码区、5'、3'非编码区在内的全长基因序列,并对cagA基因调控序列、编码序列及源自中国的CagA分子EPIYA基序分布特点进行分析.结果 Hp27cagA基因编码区长3 510 bp,编码1 169个氨基酸.5'端非编码区长649 bp,-10区、-35区分别位于起始密码子ATG上游89bp和154bp处,3'端非编码区长476 bp.Hp27cagA基因编码区核苷酸序列与东亚菌株同源性为96%,与西方菌株的同源性仅为86%左右.Hp 27 CagA分子存在典型的EPIYA基序,属于ABD型,与国际参考株NCTC11637的AB-CCC型不同.比较源自中国的HpCagA序列的EPIYA基序分布特点,未发现中国Hp分离株之间存在CagA EPIYA基序与疾病结局(胃癌、慢性胃炎和十二指肠溃疡)的聚类关系.结论 成功克隆幽门螺杆菌全长cagA基因;cagA基因编码区及非编码区序列存在东西方差异;未发现中国Hp分离株之间存在CagA EPIYA基序与疾病结局的聚类关系.
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分类号
R378
栏目名称
DOI
10.3969/j.issn.1002-2694.2007.05.015
发布时间
2007-06-25
基金项目
河南省医学科技人才创新工程项目（2000-84）
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