自延吉市自来水分离的棘阿米巴18S rDNA基因型鉴定
Genotype identification of the 18S rDNA in Acanthamoeba species isolated from tap water in Yanji city of Jilin province
摘要目的 对吉林延吉市自来水中分离的棘阿米巴分离株Acanthamoeba sp. CJY/W1 18S rDNA基因型鉴定.方法 从本地区自来水分离的Acanthamoeba sp. CJY/W1虫株中提取基因组18S rDNA,应用棘阿米巴属特意性引物PCR扩增.将扩增产物测序后用Clustal X和Genedoc软件进行序列分析,与基因库中已有T1至T12型序列进行比较并构建进化树. 结果分离的棘阿米巴分离株CJY/W1的18S rDNA全基因为2 252bp,18S rDNA基因分型最接近于T1型,但与T1型之间的基因差异为8%.结论 分离的CJY/W1株是不属于T1-T12的新的18S rDNA基因型,接近于T13(Acanthamoeba sp. UWC9,AF132134).
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