换一批登革4型病毒深圳分离株E基因序列测定及其系统发生分析
Sequence determination and phylogenetic tree analysis of the E gene of dengue virus type 4 isolated from a patient in Shenzhen
摘要目的 对深圳市2005年从登革热患者急性期血液中分离到的1株登革病毒进行型别鉴定,从分子水平分析分离株的生物学特征,追踪其可能的地域来源.方法 用C6/36细胞培养增殖病毒株SZ0524,收集病毒液.用逆转录-半套式PCR(RT-semi-nested-PCR)方法和荧光PCR方法对其进行型别鉴定.扩增病毒E基因后进行序列测定,并与不同国家和地区的登革病毒株进行同源性比较和进化树分析.结果 深圳市登革病毒分离株用4型特异性引物扩增出392bp的特异性条带,荧光PCR进一步证实了分离的病毒株为登革4型病毒.SZ0524与登革病毒4型国际标准株H241株在E基因上核苷酸同源性为99.7%,而与登革病毒1、2、3型国际标准株HAWAII、NGC、H87同源性分别为57.0%、59.2%和56.2%.基因进化树显示SZ0524株与D4-73NIID株和D4-61NIID株亲缘关系最近,其次为H241,在进化树的同一分支上,属基因Ⅰ亚型.结论 从分子水平证明从深圳市登革热患者血清中分离到的毒株确为DEN-4型病毒.结合流行病学调查资料,证实此病例为输入性感染病例,该毒株最有可能来源于东南亚一带.
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DOI
10.3969/j.issn.1002-2694.2010.01.005
发布时间
2010-03-26（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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