汉坦病毒Z5株M和S片段全基因序列测定及分析
Full-length nucleotide sequence analysis of the S and M segments in Z5 strain of Hantavirus Z5 strain
摘要目的 测定汉坦病毒Z5株M、S片段的全长序列,了解其分子结构特征,并分析Z5与其他汉坦病毒株的遗传学差异.方法 设计引物,用RT-PCR技术扩增Z5株全长M与S片段.PCR产物纯化后克隆入T载体并测定序列及分析.结果 Z5株M片段的全基因序列含有3 616个核苷酸,编码1 135个氨基酸.S全基因序列含有1 700个核苷酸,编码429个氨基酸.经核苷酸与氨基酸同源性分析,Z5株应属于汉坦病毒的汉滩型(HTN型)毒株,与Z10株同属一个亚型.结论 Z5株病毒和其他汉滩病毒病毒在核苷酸序列上有差异,但在氨基酸水平上的同源性仍较高.
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