卡氏肺孢子菌p55-v0及p55-v3基因CDS区的克隆与序列比较
Cloning and identification of the CDS region of the p55-v0 and p55-v3 gene in Pneumocystis carinii
摘要目的 扩增卡氏肺孢子菌p55-v0及p55-v3基因的CDS区,并对其进行序列分析比较.方法 从感染卡氏肺孢子菌的鼠肺组织中提取总RNA,以其为模板采用RT-PCR法分别扩增p55-v0和p55-v3编码基因,然后将相应PCR产物与T载体连接,转化感受态DH5α,在含氨苄青霉素的LB培养基上筛选重组T载体,PCR扩增,酶切,测序并进行序列比较.结果 p55-v0的CDS区基因长度为 1 245bp,编码414个氨基酸,比较发现其与文献报道的同源性分别为99.8%和100%.p55-v3 CDS区基因长度为1 053bp,编码350个氨基酸,与GenBank同源性分别为99.9%和100%.然而p55-v0与p55-v3基因之间的同源性仅20.9%.结论 本研究成功地克隆了p55-v0和p55-v3基因CDS区,分析发现p55-v0和p55-v3与国外报道的存在很高的同源性,但它们两者之间在基因组成及氨基酸组成上存在很大的差异,这为进一步比较它们的免疫功能从而阐明p55-v3的作用机制提供了基础.
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