换一批
换一批基因芯片快速检测结核分枝杆菌katG基因突变及其与异烟肼耐药相关性
Rapid detection on katG gene mutation of Mycobacterium tuberculosis using genetic microarray and the correlation between mutation and isoniazid resistance
摘要目的 了解结核分枝杆菌katG基因S315突变与异烟肼(isoniazid,INH)耐药相关性,建立快速简便的katG基因S315突变基因芯片检测方法.方法 采用二倍稀释法检测123株结核分枝杆菌临床分离菌株对INH的耐药性.PCR及测序确定上述结核分枝杆菌katG基因S315位点突变率及突变类型.根据PCR及测序结果,设计Cy3荧光标记探针并制备katG基因S315位点突变检测基因芯片.基因芯片检测结果与PCR及测序结果进行对比分析.结果 123株结核分枝杆菌临床菌株中,39.0%(48/123)菌株对INH敏感,61.0%(75/123)菌株对INH耐药.结核分枝杆菌H37Rv株及所有临床菌株均能扩增出katG基因片段.75株INH耐药菌株中,69.3%(52/75)菌株katG基因出现S315位突变,其中25株突变类型为S315N(AGC→AAC)、12株为S315T(AGC→ACC)、7株为S315I(AGC→ATC)、各有3株分别为S315T(AGC→CGC)和S315R(AGC→AGA)、2株为S315G(AGC→GGC).所制备的基因芯片对123株结核分枝杆菌katG基因S315野生型或突变型检测结果与PCR及测序结果完全一致.结论 结核分枝杆菌katG基因S315突变与INH耐药密切相关.本研究中制备的基因芯片可快速、简便、准确、敏感和特异地检测结核分枝杆菌katG基因S315突变及其类型.
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