换一批牦牛携带的产志贺毒素大肠杆菌分离株的多位点序列分型研究
Multilocus sequence typing of Shiga toxin-producing Escherichia coli isolated from yaks
摘要目的 对牦牛携带的产志贺毒素大肠杆菌(Shiga toxin-producing Escherichia coli,STEC)进行多位点序列分型(Multilocus sequence typing,MLST)分析,了解菌株的遗传进化关系及致病潜力.方法 根据E.coli MLST数据库(http://mlst.ucc.ie/mlst/dbs/Ecoli)提供的MLST方案,对青海玉树牦牛中分离的54株STEC分离株的7个管家基因进行PCR扩增并测序,通过序列比对确定其等位基因及菌株序列型(Sequence type,ST),并使用BioNumeries软件构建最小生成树(Minimum spanning tree,MST),分析牦牛ST型与HUSEC及人源主要流行血清群STEC菌株ST型间的进化关系.结果 54株牦牛STEC菌株呈现高度遗传多态性,可分为31个ST型别,其中包括7个新的等位基因型和17个新的ST型,并存在与HUSEC及主要流行血清群STEC亲缘关系相同或相近的ST型别.结论 青藏高原牦牛携带的STEC具有遗传多样性及一定的特异性,部分菌株具有对人致病的潜力.
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关键词
产志贺毒素大肠杆菌多位点序列分型序列型牦牛Shiga toxin producing Escherichia colimultilocus sequence typingsequence typeyak
分类号
R515（传染病）
栏目名称
DOI
10.3969/cjz.j.issn.1002-2694.2013.12.002
发布时间
2014-02-25（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
the National Major Science & Technology Program for Prevention and Control of AIDS,Viral Hepatitis and Oth er Major Infectious Diseases （(No.2013ZX10004-001)国家“艾滋病和病毒性肝炎等重大传染病防治”科技重大专项(2013ZX10004-001)）
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