换一批
换一批人工水和自然水环境中嗜肺军团菌mip基因分型
Sequences-based analysis of mip gene of Legionella pneumophila isolated from artificial and natural water
摘要目的 比较人工水体与自然水体环境中军团菌的mip基因差异.方法 将2003-2008年间广州和新会两市水样中分离的121株嗜肺军团菌分为人工与自然水体环境分离株两组,分别对其mip基因进行系统进化树重建,基因多态性分析,分子方差分析与中性检验,并比较两种分离来源菌株的mip基因差异.结果 121株嗜肺军团菌mip基因按分离环境来源不均匀地分布在系统进化树的拓扑分支.人工水体环境分离株共有8个等位基因型,以等位基因1型为优势群,比例55.36％,自然水体环境分离株有11个等位基因型,以等位基因28型为优势群,比例40％.人工水体环境分离株的核苷酸多态性与平均核苷酸差异大于自然水体环境分离株.分子方差分析结果显示两种环境分离株mip基因差异占总体差异的14.43％.中性检验证明人工水体环境分离株的mip3’末端处,Tajima检验P＜0.05,D值显著大于0.而自然环境分离株在此区域未见显著性差异.结论 嗜肺军团菌mip基因在人工与自然水体环境分离株之间存在显著差异,这种差异可能来源于人工水体环境对嗜肺军团菌种群大小的影响或平衡选择作用.
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关键词
嗜肺军团菌人工水体环境自然水体环境基因多态性Legionella pneumophilaartificial water systemenvironmental water systemgene polymorphic
分类号
R378
栏目名称
实验研究
DOI
10.3969/cjz.j.issn.1002-2694.2014.05.011
发布时间
2014-06-19
基金项目
the National Natural Science Foundation of China (Nos.31270049 & 31300004)国家自然科学基金面上项目
国家自然科学基金青年科学基金项目
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