云南省猪戊型肝炎病毒全基因组扩增及进化分析

Amplification and evolution analysis on full-length genome of swine hepatitis E virus

二维码有效期 120s

摘要目的对猪戊型肝炎病毒全长基因组进行扩增,分析其进化关系,为HEV的感染性克隆研究奠定基础.方法利用巢式逆转录聚合酶链反应(RT-nPCR)和RACE技术对猪粪便中HEV样品进行全基因组扩增,利用DNAStar和MEGA4.0软件进行同源性比较和进化树分析.结果 RT-nPCR方法扩增出HEV的5段目的基因序列和RACE技术扩增出HEV的5'和3'端,序列比对结果正确,HEV全长扩增成功.同源性分析显示其与新疆株(GU119961)同源性较高(96.1％).系统进化树显示该病毒属于基因4型h亚型猪HEV.结论 HEV全基因组序列扩增成功,为深入研究HEV奠定基础.

作者杨臣臣 ^[1] 龙飞燕 ^[1] 毕艳红 ^[1] 李云龙 ^[1] 王珏 ^[1] 禹文海 ^[1] 井申荣 ^[1] 黄芬 ^[1] 学术成果认领

作者单位昆明理工大学医学院,昆明,650500 ^[1]

关键词猪戊型肝炎病毒巢式逆转录PCR 全长基因组分析 swine hepatitis E virus RT-nPCR complete genome sequences analysis

主题词猪(Swine)基因组(Genome)戊型肝炎病毒(Hepatitis E virus)性(Sex)目的(Goals)

分类号 R373.2

栏目名称 实验研究

DOI 10.3969/cjz.j.issn.1002-2694.2015.06.011

发布时间 2015-08-14

基金项目

国家自然科学基金资助 云南省自然科学基金 中国博士后科学基金(No.2014M562672)资助,杨臣臣和龙飞燕同等贡献 the Natural Science Foundation of China the Natural Science Foundation of Yunnan Province in China the China Postdoctoral Science Foundation