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布氏菌分离株16SrDNA基因遗传进化分析

Gene genetic evolution of 16SrDNA for Brucella strains

摘要目的 检测内蒙古布氏菌临床分离株的16SrDNA基因序列,构建16SrDNA遗传进化树,确定该菌株的分类地位.方法 用BCSP31-PCR对临床分离株检测,再进行16SrDNA双向测序;从GeneBank下载标准参考菌株和与布氏菌有共同抗原细菌的16SrDNA基因序列;用Mega6.0进行序列比对并构建遗传进化树.结果 BCSP31-PCR结果显示均有223 bp扩增条带,16SrDNA测序得到单一基因序列;比对后发现有4处特异片段,经Blast比对,位于844-1224包括380 bp的片段为布氏菌独有;进化树显示布氏菌临床分离株与标准菌株聚在1个末端分支上,遗传距离接近0,无法精细区分相互关系;与人苍白杆菌聚集在1个亚分支上,遗传距离0.019;与其它试验菌株如霍乱弧菌、小肠结肠炎耶尔菌遗传进化距离较远,遗传距离>0.02.结论 从遗传进化角度对布氏菌分离株与标准菌株的亲缘关系进行分析,布氏菌所有种型遗传距离接近,提示布氏菌16SrDNA为高度保守序列,不宜做遗传进化分析的靶基因;布氏菌与人苍白杆菌有较近的亲缘关系;布氏菌属16SrDNA特有的380 bp的基因片段可作为布氏菌快速鉴定的靶序列.

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作者 刘志国 [1] 崔步云 [2] 王妙 [3] 刘日宏 [3] 夏咸柱 [4] 学术成果认领
分类号 R378
栏目名称
DOI 10.3969/cjz.j.issn.1002-2694.2015.08.003
发布时间 2015-10-26(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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中国人兽共患病学报

中国人兽共患病学报

2015年31卷8期

700-703页

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