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基于COI基因的柴达盆地常见寄生蚤种的DNA条形码分析

DNA barcoding based on mt DNA COI gene sequence of fleas from Qiadam Basin in Qinghai, China

摘要目的 COI基因对柴达木盆地部分蚤种进行分子生物学鉴定,旨在完善蚤类传统形态分类法的不足.方法 PCR扩增68份蚤类标本的COI基因片段(约600 bp)并进行测序和比对;用MEGA 6软件的K2-P双参数模型计算种内及种间遗传距离,以邻接法(neighbor-joining,NJ)构建系统发育树.结果 共测得柴达木盆地19种蚤的68条COI基因序列,种内遗传距离0.01%~2.9%,种间遗传距离3%~15.4%,种间遗传距离显著大于种内遗传距离.结论 NJ树显示同一物种形成高支持率的单系,种间分支很明显,表明COI可以作为DNA条形编码基因对柴达木盆地的常见蚤类进行物种鉴定.

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DOI 10.3969/j.issn.1002-2694.2018.00.197
发布时间 2019-03-06(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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中国人兽共患病学报

中国人兽共患病学报

2018年34卷12期

1107-1111页

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