云南省大理市啮齿动物携带冠状病毒和戊型肝炎病毒的调查

Investigation of coronavirus and hepatitis E virus in rodents in Dali City,Yunnan Province

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摘要目的调查云南省大理市啮齿动物冠状病毒(Coronavirus,CoV)和戊型肝炎病毒(Hepatitis E Virus,HEV)感染率.方法 2020年8月～2021年8月在大理市4个乡镇采集啮齿动物样本,采用巢式PCR扩增CoV和HEV的保守序列基因,用生物信息学软件进行同源性与遗传进化分析.结果共捕获76只啮齿动物属于5属6种,CoV感染动物为褐家鼠(Rattus norvegicus)和黄胸鼠(Rattus tanezumi),感染率分别为 40.74％(11/27)、2.38％(1/42);HEV 感染动物为褐家鼠和黄胸鼠,感染率分别为14.81％(4/27)、2.38％(1/42).在银桥镇捕获的2只褐家鼠中同时检测到CoV和HEV,感染率为7.41％(2/27).基于 CoV 的部分 RNA 依赖的 RNA 酶(RNA-dependent RNA polymerase,RdRp)的 434 bp 核苷酸片段分析,11 株CoV阳性样本均来自褐家鼠,为α-CoV,与来自中国福建黄毛鼠(Rattus losea)RtRl/FJ2015同源性最高,为99.73％～99.74％;1株CoV阳性样本来自黄胸鼠,为β-CoV,与来自中国云南板齿鼠(Bandicota indica)Ruili66同源性最高,为98.21％.基于HEV的部分RdRp的340 bp核苷酸片段分析,5株HEV阳性样本均来自褐家鼠,均为HEV-C,与来自中国香港免疫移植病人pt 5株同源性最高,为95.87％～96.21％.结论云南省大理市啮齿动物中存在CoV和HEV感染,2种病毒的宿主动物与人关系密切,应加强相关病毒的监测与研究.