换一批摘要目的 分析散养羊粪便中克罗诺菌的分离与种鉴定,为克罗诺菌相关风险研究奠定基础.方法 采集北京市某区农村地区散养羊粪便标本,参考GB 4789.40-2016标准进行克罗诺菌分离培养;对疑似菌株进行全自动生化鉴定、16S RNA全长序列比对分析以及菌株基因组测序.基于基因组序列,进行菌株基于基因组的平均核苷酸一致性(ANI)分析以及多位点序列分型(MLST)分析;对核实鉴定后的克罗诺菌使用肉汤稀释法进行15种抗生素敏感性检测.结果 共采集129件羊粪便标本,其中获得26株疑似菌株.不同鉴定方法鉴定结果不完全一致.ANI分析结果显示26株菌中14株菌为克罗诺菌,分别属于4个菌种(阪崎克罗诺菌、丙二酸盐克罗诺菌、苏黎世克罗诺菌、都柏林克罗诺菌),14株克罗诺菌中8株为苏黎世克罗诺菌,样本克罗诺菌的检出率为10.85％(14/129).1株阪崎克罗诺菌的分型为ST40,2株丙二酸盐克罗诺菌的分型分别为ST7和ST201,3株都柏林克罗诺菌分为2个亚型,其ST型别分别为ST809、ST810和ST666.8株苏黎世克罗诺菌分别为ST25(3株)、ST811、ST813、ST814(2株)和ST815.14株克罗诺菌对检测的抗生素均为敏感.结论 本地区散养羊携带阪崎克罗诺菌及其它克罗诺菌菌种病原菌.全自动生化鉴定及基于16SrRNA序列分析鉴定对于克罗诺菌的鉴定可能存在错误.
更多相关知识
关键词
克罗诺菌菌种鉴定基因组测序平均核苷酸一致性分子分型抗生素敏感性Cronobacterspecies identificationwhole-genome sequencingaverage nucleotide identitymolecular typingantibiotic sensitivity
栏目名称
DOI
10.3969/j.issn.1002-2694.2023.00.059
发布时间
2023-08-09（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
- 浏览13
- 被引2
- 下载0
相似文献
- 中文期刊
- 外文期刊
- 学位论文
- 会议论文
