2017-2019年济宁市健康人群脑膜炎奈瑟菌流行病学和基因组学分析

Epidemiologic and genomic analysis of Neisseria meningitidis isolated from a healthy population in Jining City during 2017-2019

二维码有效期 120s

摘要目的了解济宁市健康人群脑膜炎奈瑟菌流行情况及其基因组特征.方法采集2017-2019 年流行前期、流行期、流行后期不同年龄组健康人群的咽拭子标本,进行菌株分离培养、生化试验、血清凝集试验,分离到的菌株进行基因测序,利用PubMLST数据库进行多位点序列分型(MLST)、核心基因组多位点序列分型(cgMLST)、疫苗抗原分析,利用IQ-TREE和Splits Tree构建系统发育树.结果 2 017-2 019 年共检测1 086 份健康人群咽拭子标本,分离出21 株脑膜炎奈瑟菌,健康人群平均带菌率为1.93％.其中流行前期带菌率为0.93％,流行期带菌率为2.30％,流行后期带菌率为1.83％.17～19 岁人群带菌率较高,3～5 岁儿童及≥20 岁成人中未检出阳性菌株.检出的21 株菌株中,B群15 株,C 群1 株,不可分群5株.通过基因组分析,主要的ST 型为ST-12 301 和ST-14 65 5,ST-17 464、ST-17 46 5、ST-17 466、ST-17 467 和ST-17468 为本研究新发现的ST型.进行基因测序的19 株菌株中,有8 株属于4821 克隆群,其余菌株不属于确定的克隆群,有3 株血清型为不可分群的菌株但其基因型为B型.结论济宁市2017-2019 年健康人群中脑膜炎奈瑟菌血清群以B群为主.本研究新发现5 种MLST序列型,提示近几年菌株基因组存在微进化.MLST序列型的变迁有可能导致流行模式发生改变,有必要开展持续监测.17～20 岁人群带菌率高,应密切关注菌株在人群中的扩散传播,以防引起流脑病例.