换一批上海市首次自腹泻患者中检出格隆柏沙门菌的表型和分子特征研究
Phenotypic and molecular characteristics of a Salmonella Grumpensis isolate from a patient with diarrhea in Shanghai,China
摘要目的 研究上海市首次自腹泻患者中检出格隆柏沙门菌的表型和分子特征,为沙门菌病防控提供依据.方法 对格隆柏分离株(2023JD76)进行生化鉴定、血清凝集试验、抗菌药物敏感性试验以及全基因组测序(whole genome sequencing,WGS).收集全球格隆柏沙门菌全基因组序列,进行血清分型、多位点序列分型(multilocus sequence typing,MLST)、耐药基因和毒力基因预测,分析2023JD76与全球株的系统进化关系.结果 2023JD76血清分型符合抗原式(Sal-monella Grumpensis,13,23:d:1,7),对20种抗菌药物均敏感,MLST型预测为2060(ST2060),携带氨基糖甙类药物耐药基因aac(6')-Iaa和5类毒力基因,包括黏附基因csg、rat,分泌和转运基因sip、inv,伤寒毒素基因cdt、plt,侵袭性基因营养代谢因子mgt和抗菌肽抗性因子mig.36株全球格隆柏菌株共携带10种耐药基因,不同毒力基因携带率为58.33％～100％.进化树将全球格隆柏沙门菌基因组分为2个支系,支系Ⅰ以ST751(88.89％,16/18)为主,支系Ⅱ以ST2060(89.47％,17/19)为主.本次分离菌株2023JD76处于支系Ⅱ内,其序列型与全球人源粪便株和人源脑脊液株全基因组序列密切相关.结论 本研究首次分离国内腹泻患者中的格隆柏沙门菌,不同地理来源菌株间耐药表型差异大,应加强监测以防范全球潜在的传播风险.
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关键词
格隆柏沙门菌全基因组测序多位点序列分型耐药基因毒力基因Salmonella Grumpensiswhole genome sequencingmultilocus sequence typingantimicrobial resistance genevirulence gene
栏目名称
DOI
10.3969/j.issn.1002-2694.2024.00.115
发布时间
2024-10-15（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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