重庆市输入性卵形疟原虫curtisi和wallikeri亚种分子特征分析
Molecular characterization of Plasmodium ovale curtisi and Plasmodium ovale wallikeri imported cases in Chongqing
摘要目的 为了解重庆市输入性卵形疟原虫curtisi和wallikeri亚种的分子特征,对卵形疟病例的卵形疟原虫Cox1、Cytb、Tra、Dhfr、K13基因位点多态性进行分析.方法 回顾性分析2013-2023年确诊的卵形疟原虫感染患者血样,PCR扩增卵形疟原虫Cox1、Cytb、Tra、Dhfr、K13基因的部分片段,利用测序技术及生物信息学方法区分2个亚种,分析卵形疟curtisi和wallikeri亚种核苷酸多态性位点以及氨基酸突变位点等多态性.结果 以ssrRNA区分26例卵形疟(curtisi亚种14例;wallikeri亚种12例)与Cox 1、Cytb、Tra基因分类结果一致.Cox1基因在145、153等13个位点呈现二态性,仅在528、862位点氨基酸M176I、I288V变异,单例N337H变异.Cytb基因亚种间发现12个位点发生碱基置换,仅248号氨基酸M2481突变.Tra基因发现49个核苷酸二态性位点,致18个氨基酸突变,curtisi型样本中poc1型比poc2型多PINTIN-PINTIN 和TITPIS氨基酸单元.Dhfr基因突变率较高,25%样本出现S58R突变.K13基因亚种内不呈单态,1例样本为杂合.结论 确认了重庆市输入性卵形疟在Cox1、Cytb、Tra、Dhfr、K13基因片段中curtisi和wallikeri亚种间的二态性位点、突变位点,丰富了输入性卵形疟原虫两个亚种基因多态性信息.
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