福建沿海城市鼠腺病毒和沙粒病毒调查及进化分析
Phylogenetic analysis of adenovirus and arenavirus in rodents from coastal cities in Fujian Province
摘要目的 了解福建省沿海城市鼠类携带病毒及病毒基因特征情况.方法 采集宁德、福州、泉州和漳州4市鼠肠道组织样本,采用巢式PCR扩增腺病毒DNA polymerase(DPOL)基因,RT-PCR扩增沙粒病毒large(L)基因,采用生物信息学软件进行同源性和遗传特征分析.结果 本调查共捕获152只鼠,腺病毒阳性率为4.61%,野鼠阳性率为5.26%,家鼠阳性率为4.21%.司氏屋顶鼠、褐家鼠、黄胸鼠和黄毛鼠检出腺病毒,首次在司氏屋顶鼠中检出鼠腺病毒.相关因素分析显示,不同鼠种、性别、鼠龄和生境,鼠腺病毒感染率差异无统计学意义.序列分析表明福建沿海城市鼠类感染的腺病毒为鼠2型腺病毒(Murine adenovirus 2)和鼠3型腺病毒(Murine adenovirus 3),与其他地区的鼠腺病毒序列差异较大,核酸同源性介于72.25%~91.01%.所有鼠标本均未检测出沙粒病毒.结论 福建沿海城市鼠类存在腺病毒感染,但尚未发现沙粒病毒感染,这为我省进一步开展鼠腺病毒和沙粒病毒的调查研究提供有益的本底资料.
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