肉鸡屠宰环节多重耐药ST314肯塔基沙门菌的全基因组序列分析
Whole genome sequencing and analysis of multidrug resistant ST314 Salmonella Kentucky from a broiler slaughterhouse
摘要目的 分析肉鸡源多重耐药ST314肯塔基沙门菌的耐药特征、毒力基因和遗传进化背景.方法 测定肉鸡屠宰环节中分离得到的ST314肯塔基沙门菌对临床常见抗菌药物的敏感性.通过全基因组测序(WGS)和生物信息学方法分析其耐药基因、毒力因子和水平移动元件(MGEs)等相关信息.结果 三株ST314克隆均表现出高度耐药性.F4-2S对7类14种药物、F4T对7类13种药物以及Y23对6类9种药物耐药.F4-2S与F4T具有高度同源性,均携带9类13种耐药基因,以及分泌系统和效应蛋白等一系列毒力因子.含有的IncR和IncX1型质粒增强了其耐药性和致病性.Y23基因组完成图包含一条染色体和两个质粒.染色体上仅有一种耐药基因,但携带与细菌入侵有关的Ⅲ型分泌系统(T3SS)等众多毒力因子,而质粒pY23-1上携带8类19种耐药基因.相似质粒的比对结果显示,pY23-1与pZ1323SSL0055、pSAL-045同源关系较近,均携带多种耐药基因,提示其在细菌耐药进化中可能扮演重要角色.结论 ST314肯塔基沙门菌具有复杂的耐药机制及致病潜力,质粒上的耐药基因及其MGEs有助于细菌耐药性的产生和传播.染色体含有的多种毒力因子,可能是导致ST314克隆毒力增强的重要原因.
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