换一批环青海湖地区鼠疫疫源地鼠疫菌单核苷酸多态性研究
Single nucleotide polymorphism typing of Yersinia pestis in natural plague foci around Qinghai Lake
摘要目的 基于鼠疫菌全基因组单核苷酸多态性分析,明确环青海湖地区鼠疫疫源地鼠疫菌分子特征,为该地区鼠疫菌的分子流行病学分析和溯源奠定基础.方法 利用全基因组测序技术,获得环青海湖地区鼠疫自然疫源地84株代表性鼠疫菌株的全基因组序列,以NCBI数据库中的鼠疫菌及假结核耶尔森菌IP32953的全基因组序列为参考,比对2 298个SNP位点并进行分析.结果 1957-2020年,环青海湖地区鼠疫疫源地分离的84株代表性鼠疫菌株分为1.IN2和3.ANT1 两个分支,其中1.IN2分支作为该地区鼠疫菌的特征种群遍及所有疫情流行年代;鼠疫菌SNP地区分布显示除乌兰县外其余5个县的鼠疫菌均位于1.IN2分支中;不同宿主SNP分布显示,除分离自喜马拉雅旱獭和狗体内的2株鼠疫菌位于3.ANT1分支外,其余均位于1.IN2分支中.结论 环青海湖地区鼠疫疫源地鼠疫菌的SNP种群结构较为单一,基于鼠疫菌基因组单核苷酸多态性分析,可以为该地区鼠疫疫情的溯源和防控措施的制定提供科学依据.
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关键词
环青海湖地区鼠疫疫源地鼠疫菌单核苷酸多态性Qinghai Lake regionnatural plague fociYersinia pestissingle nucleotide polymorphism(SNP)
栏目名称
DOI
10.3969/j.issn.1002-2694.2025.00.094
发布时间
2025-08-14（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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