换一批福建部分地区产超广谱β内酰胺酶宋内志贺菌基因组特征及质粒携带耐药基因的快速鉴定
Genomic characterization of ESBL-producing Shigella sonnei and rapid identi-fication of resistance genes carried by plasmids in parts of Fujian Province
摘要目的 分析福建省产超广谱β内酰胺酶(ESBLs)宋内志贺菌基因组特征,并对共存于质粒的blaCTX-M耐药基因进行快速鉴定.方法 收集福建省6个地区2007-2024年产ESBLs宋内志贺菌26株,微量肉汤法检测抗菌素最小抑菌浓度(MIC);利用二代和三代测序技术进行全基因组测序(WGS),预测耐药基因、质粒、插入序列(IS)和blaCTX-M基因环境,Roary构建聚类树,cgSNP(core genome single nucleotide polymorphism)分析菌株的全球进化地位.S1核酸内切酶脉冲场凝胶电泳(S1-PFGE)、微滴式数字PCR(ddPCR)及质粒接合转移试验确认blaCTX-M在质粒上的定位和水平传播.结果 26株产ESBLs宋内志贺菌均为多重耐药菌,全部对头孢噻肟耐药,有6株对阿奇霉素耐药.WGS分析显示,26株菌共携带17种耐药基因、9种质粒复制子、15种插入序列和1种转座子Tn7.blaCTX-M-14blaCTX-M-15和blaCTX-M-64、ermB和mphA的阳性率分别为61.54％、30.77％、7.69％、11.54％和11.54％,blaCTX-M基因环境可分为4种类型.Roary分析可将26株菌分为4个簇;cgSNP显示,它们均归属于独特的基因型3.7.6中国分支.除1株blaCTX-M-14位于染色体外,所有blaCTX-M分布于3种类型的质粒上,S1-PFGE和ddPCR鉴定结果与测序结果一致.结论 福建产ESBLs宋内志贺菌基因组携带大量耐药因子,S1-PFGE和ddPCR可成为检测质粒携带耐药基因的有效工具.
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关键词
宋内志贺菌超广谱β内酰胺酶全基因组测序耐药基因质粒Shigella sonneiextended-spectrum beta-lactamases(ESBLs)whole genome sequencingantibiotic resistant genesplasmid
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DOI
10.3969/j.issn.1002-2694.2025.00.136
发布时间
2026-01-21（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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