换一批宁夏地区2022-2024年布鲁氏菌全基因组特征及遗传相关性分析
Whole genome characteristics and genetic correlations of Brucella in the Ningxia Region from 2022 to 2024
摘要目的 对2022-2024年宁夏分离的布鲁氏菌株进行分子流行病学及基因组特征分析,明确宁夏菌株的遗传多样性、进化动态及潜在传播网络,为区域性防控策略优化提供依据.方法 基于全基因组测序技术对68株布鲁氏菌进行基因组特征分析、SNP位点和插入缺失变异分析及MLST位点分析.使用Anvio v8对测序菌株及下载菌株进行泛基因组分析及平均核苷酸相似度(ANI)分析.基于全基因组单核苷酸多态性(wgSNP),采用 MEGA 11的最大似然法(Maximum Likelihood,ML)构建系统发育树.结果 本研究菌株的平均基因组大小为(3.29±0.12)Mb,GC含量为(57.25±0.03)%,与布鲁氏菌参考基因组的平均核苷酸相似度(ANI)达99.86%,证实为种内高度保守进化分支.泛基因组分析表明,宁夏菌株呈现闭合型泛基因组特征(alpha值<0.3),但携带7个独特附属基因.MLST分型显示所有菌株均为ST8型.核心基因组SNP系统发育分析进一步揭示:①宁夏菌株与美国分离株(BmWS93)形成单系群(遗传距离为25SNPs);②与国内内蒙古、甘肃等地的菌株遗传距离≤25SNPs.③本地菌株间遗传多样性极低(同地区存在最近遗传距离为1SNP,跨地区存在最近遗传距离3SNPs).结论 本研究基于全基因组测序揭示宁夏地区布鲁氏菌株呈现高度遗传保守性,属于ST8型优势克隆群.菌株与我国内蒙古、甘肃及美国分离株遗传关系密切,可能存在跨区域传播链;本地菌株极低的遗传差异进一步表明疫情可能源于近期共同传染源.本研究为该地区布病传播溯源和精准防控提供了关键分子依据.
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10.3969/j.issn.1002-2694.2026.00.009
发布时间
2026-04-14（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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