鹅源禽多杀性巴氏杆菌的分离鉴定和全基因组测序分析
Isolation,identification,and whole-genome sequencing analysis of goose-derived avian Pasteurella multocida
摘要目的 禽巴氏杆菌病(Avian pasteurellosis)是由多杀性巴氏杆菌(Pasteurella multitocida,Pm)引起的一种急性、高致死性传染病,可感染多种禽类,严重危害家禽养殖业.为确定新疆某鹅场成年鹅发病原因,并探究其致病原分子流行病学特征.方法 无菌采集病死鹅肝脏、肺脏等组织,通过PCR/RT-PCR检测样品中多杀性巴氏杆菌、禽致病性大肠杆菌、禽流感病毒等病原,并针对致病原进行分离鉴定、生化实验、小鼠致病性试验,并通过全基因组测序对分离菌株进行毒力、耐药基因注释和遗传进化等分子生物学信息分析.结果 分离鉴定到1株ST85型鹅源多杀性巴氏杆菌PM2023,其基因组全长2 272 031 bp,编码2 136个蛋白质,包含98个毒力基因和40个耐药基因,可引起小鼠死亡.SNP系统发育分析显示,分离菌株与多数禽源多杀性巴氏杆菌聚类于同一进化分支.结论 本研究确定该鹅场成年鹅发病致死是由于感染禽多杀性巴氏杆菌,并进一步分离鉴定了该菌株,同时揭示了多杀性巴氏杆菌的流行情况,为多杀性巴氏杆菌的生物学特性研究和科学防控奠定了理论基础.
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