纳米孔测序技术在耐药结核病快速诊断中的应用价值
Application value of nanopore sequencing technology in the rapid diagnosis of drug-resistant tuberculosis
摘要目的 验证纳米孔测序技术在检测临床标本中结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis,M.tb)耐药性的价值.方法 收集2023年2月至2024年1月长春市传染病医院就诊的136例疑似耐药结核病患者的临床样本(痰、支气管肺泡灌洗液、胸水等)进行纳米孔测序检测,并将纳米孔测序检测结果与MGIT960液体培养、快速分子检测(Xpert MTB/RIF)结果进行比对.以常规表型药敏试验结果为参考标准,分析纳米孔测序法对结核分枝杆菌耐药性的快速诊断价值.结果 纳米孔测序法发现利福平耐药基因突变主要在rpoB S531L位点上,突变率为68.57%(72/105);异烟肼耐药基因突变主要在KatG S315T、inhA c15t位点上,突变率分别为56.41%(44/78)、26.92%(21/78);乙胺丁醇耐药基因突变主要在embB M306V、embB M306I位点上,突变率分别为40.00%(20/50)、24.00%(12/50);链霉素耐药基因突变主要在rpsL K43R位点上,突变率为77.14%(54/70);喹诺酮类药物耐药基因突变主要在gyrA D94G、gyrA A90V位点上,突变率分别为36.06%(22/61)、27.86%(17/61).纳米孔测序技术检测利福平、异烟肼、乙胺丁醇、链霉素、喹 诺 酮 类 的 敏 感 度 分 别 为:100%、92.21%、92.45%、87.14%、91.53%,特异度分别是为:83.78%、88.14%、98.80%、86.36%、90.91%,准确率分别是:95.59%、90.44%、96.32%、86.76%、91.18%,Kappa值分别为0.88、0.80、0.92、0.74、0.82.结论 纳米孔测序技术在耐药结核病快速检测中有较高的应用价值,能够满足临床及时诊断耐药结核病的需求.
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