一起由产气荚膜梭菌引起的食源性疾病暴发事件的病原学分析
Etiological analysis of a foodborne disease outbreak caused by Clostridium perfringens
摘要目的 对2023年武汉市一起由产气荚膜梭菌引起的食源性疾病暴发事件进行病原学分析,为类似事件实验室处置方法的改进提供参考.方法 采用实时荧光聚合酶链式反应(PCR)方法对采集的肛拭样本和食物样本进行多重病原筛查和肠毒素cpe检测.根据初筛结果对样本进行分离培养,生化鉴定和飞行时间质谱鉴定.分离到的产气荚膜梭菌菌株进行全基因组测序,部分未分离到产气荚膜梭菌的样本进行宏基因组测序.结果 本次事件共采集样本25份(包括15份肛拭样本和10份食物样本),其中有4份肛拭样本和2份食物样本检出产气荚膜梭菌和肠毒素cpe的保守基因片段.共分离到2株F型产气荚膜梭菌.可疑食物样品中产气荚膜梭菌数为105 CFU/g.全基因组测序结果显示,2株检出菌的核酸序列仅存在3个位点差异,均为ST147型,均存在毒力基因plc、nanH、cloSI、colA、cpe和耐药基因tetA(P).宏基因组测序结果显示,肛拭样本中梭菌属的物种相对丰度为3.85%.本次事件分离的产气荚膜梭菌序列在宏基因组测序数据中的碱基覆盖度为92.58%,其毒力基因cpe和plc的碱基覆盖度分别为91.15%和100%.结论 本次事件由产气荚膜梭菌引起.在产气荚膜梭菌诊断标准滞后的情况下,高通量测序技术与传统方法相结合可考虑应用于食源性疾病暴发事件进行病原学分析.
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