两株蛋白核小球藻rbcS cDNA全序列的克隆和分析
Cloning and analysis of rbcS full-length cDNA sequences from two strains of Chlorella pyrenoidosa
摘要以2株蛋白核小球藻(Chlorella pyrenoidosa)F-9和820为实验材料,根据已知绿藻rbcS基因设计简并引物,分别克隆到2条245 bp的cDNA片段,以此片段为基础使用cDNA末端快速扩增(RACE)技术,获得了2条长度分别为861 bp和907 bp的rbcS基因.序列分析表明,蛋白核小球藻F-9和820的rbcS分别编码181和184个氨基酸,编码区具有与高等植物rbcS保守序列YYDGRYWTMWKLPMFG相类似的结构,起始密码子附近有Kozak保守序列(A/GXXATGG),3'非翻译区有加尾信号TGTAA.同源性分析结果表明,F-9与蛋白核小球藻(GenBank登录号BAE48226)的相似性最高(91%),而F-9与820、F-9和普通小球藻(C.vulgaris)的相似性分别为64%和50%.这2条rbcS基因与其他绿藻和高等植物也表现了广泛的同源性,但相似性不高.该研究旨在为rbcS基因的功能和表达研究奠定基础.
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