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江苏高邮罗氏沼虾池塘养殖可培养微生物组成调查

The composition of cultivable bacteria in the pond aquaculture system of Macrobrachium rosenbergii in Gaoyou City,Jiangsu Province

摘要为了探明罗氏沼虾(Macrobrachium rosenbergii)池塘养殖环境中重要微生物的组成,以提升健康养殖管理技术,分别于2019年7月、8月和10月,在江苏高邮市罗氏沼虾主养区开展了罗氏沼虾池塘养殖系统可培养环境微生物的组成调查.采用LB培养基分离纯化了罗氏沼虾肝胰腺、肠道、鳃及养殖水体中可培养的细菌,利用细菌16S rRNA基因分子鉴定技术对分离菌株进行初步鉴定;采用高通量测序技术分析了"铁壳"虾(养殖期生长缓慢)及铜绿微囊藻暴发池塘水环境微生物群落组成.以达卡气单胞菌(Aeromonas dhakensis)为受试病原菌,分析了池塘养殖系统中潜在病原拮抗菌的种类及效果.3次调查共分离可培养细菌605株,成功鉴定601株,分别属于37个属119种,其中罗氏沼虾体内分离到菌株23属76种,养殖水体中分离到28属81种.确定了池塘养殖系统中存在气单胞菌(Aeromonas spp.)、肠杆菌(Enterobacter spp.)、乳球菌(Lactococcus spp.)、弧菌(Vibrio spp.)等属的潜在病原菌.发生"铁壳"虾症的虾池优势环境微生物种类组成及占比与健康虾池相近,但微小杆菌属(Exiguobacterium)与不动杆菌属(Acinetobacter)细菌占比高于健康虾池.铜绿微囊藻暴发影响环境微生物的组成结构,嗜水气单胞菌属细菌占比增大.从池塘养殖系统筛选到甲基营养型芽孢杆菌(Bacillus methylotrophicus)、贝莱斯芽孢杆菌(B.velezensis)、解淀粉芽孢杆菌(B.amyloliquefaciens)等潜在益生菌对气单胞菌具有较强拮抗作用.调查结果可为掌握罗氏沼虾池塘养殖系统细菌性病原组成及建立防控技术提供理论依据.

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