南京市一起疑似克罗诺杆菌引起食源性疾病暴发的病原学鉴定及分子分型

Etiological identification and molecular typing analysis of a foodborne disease outbreak case caused by Cronobacter spp.in Nanjing City

导出学术成果认领

摘要目的对南京市某学校发生的一起疑似食源性疾病暴发事件进行溯源分析,探讨致病菌株病原特征及分子流行病学关系,为食源性疾病暴发事件溯源及处置提供参考依据.方法采集食源性疾病暴发事件相关样本共47份,提取样本DNA进行食源性致病菌及腹泻病毒核酸检测,同时按照常规细菌分离培养方法进行病原菌分离鉴定.应用微量肉汤稀释法对分离到的克罗诺杆菌菌株进行耐药性检测,同时提取所有菌株核酸进行全基因组测序(WGS)并进一步进行菌株的致病性预测和基于直系同源基因簇的多位点序列分析(cogMLST).结果从30份样本中检测出克罗诺杆菌核酸阳性,未检测到其他常见肠道致病菌及腹泻病毒核酸.共分离得到9株克罗诺杆菌菌株(BQ1～BQ9),其中患者肛拭子6份,供餐企业工作人员肛拭子2份、食品留样1份.9株菌株的耐药谱基本一致.PathogenFinder在线预测这9株菌株均大概率具有致病性.MLST分型结果显示9株克罗诺菌株分属5个ST型,其中BQ3、BQ4和BQ9为ST8型.cogMLST分析发现,从患者肛拭子中分离出的BQ3和从食品留样中分离出的BQ9在进化树上聚为1支,并且只有2个ST位点的差异,两者高度同源.结论本次食源性疾病暴发事件仅分离到克罗诺杆菌菌株,且分子流行病学分析结果显示来源于食品留样和一例患者的菌株高度同源.尽管克罗诺杆菌通常被认为是一种侵犯婴幼儿及免疫力低下人群的条件致病菌,但本次研究数据提示克罗诺杆菌作为条件致病菌有可能成为健康成年人及青少年急性胃肠炎的致病因子,需重新评估其在食源性疾病中的致病风险,加强对克罗诺杆菌在食源性疾病人群和除婴幼儿奶粉及辅食以外食品中的监测.

作者龚红瑾 ^[1] 郑东宇 ^[2] 斯佳丽 ^[1] 王璇 ^[1] 何敏 ^[1] 王磊 ^[3] 闻艳 ^[3] 雍玮 ^[1] 学术成果认领

作者单位南京市疾病预防控制中心,江苏南京 210000 ^[1] 江苏省疾病预防控制中心,江苏南京 210000;国家卫生健康委员会肠道病原微生物重点实验室,江苏南京 210000;江苏省新发突发重大传染病病原微生物重点实验室,江苏南京 210000 ^[2] 雨花台区疾病预防控制中心,江苏南京 210000 ^[3]

关键词食源性疾病暴发克罗诺杆菌食源性致病菌多位点序列分型全基因组测序耐药性 Foodborne disease outbreak Cronobacter spp.foodborne pathogens multilocus sequence typing whole genome sequencing antimicrobial susceptibility

分类号 R155

栏目名称 研究报告

DOI 10.13590/j.cjfh.2024.09.003

发布时间 2025-01-25

基金项目

南京市卫生科技发展专项资金项目 南京市公共卫生检验检测重点实验室