喀什帕米尔高原牦牛乳传统发酵生奶酪中微生物多样性及分子鉴定
Microflora Diversity and Molecular Identification from Traditional Fermented Raw Cheese of Yak Milk in Tashkorghan Pamirs
摘要目的:研究喀什帕米尔高原塔县地区传统牦牛乳发酵生奶酪中微生物的多样性和菌群结构.方法:从帕米尔高原区不同牧民家庭中采集 6 份生奶酪样品,采用高通量测序技术分析其微生物多样性.通过纯培养方法分离传统牦牛乳发酵生奶酪样品中的菌种,采用传统分类与 16S rDNA序列测定和 26S rDNA D1/D2 间隔区序列测定方法对分离的细菌和酵母菌进行种属鉴定.结果:通过细菌的 16S rDNA基因V3-V4 区测序,共获优化序列 945432.通过真菌的ITS区域测序,共获优化序列 1302962.在属水平上,优势细菌属为乳杆菌属和链球菌属,优势真菌属为克鲁维酵母属、有孢圆酵母属、伊萨酵母属和未分类的真菌类群.根据主坐标轴分析,6 份样品的群落结构间既有相似性又有差异性.在MRS和MC培养基中共分离 52 株细菌,在YGC培养基上共分离 46 株酵母菌,通过细菌 16S rDNA序列和真菌 26S rDNA D1/D2 隔间区序列分析,将 52 株细菌归为 7 个属 11 个种,分别是耐久肠球菌、粪肠球菌、热带芽孢杆菌、蜡样芽孢杆菌、类副粘杆菌、希腊假单胞菌、副干酪乳杆菌、鸡乳杆菌、霍氏肠杆菌、细黄链霉菌、表皮葡萄球菌.将 46 株酵母菌归为 8 个属 9 个种,分别是解脂耶氏酵母、诞沫假丝酵母、发酵毕赤酵母、库德毕赤酵母、普兰久浩酵母、异常威克汉逊酵母、马克思克鲁维酵母、东方伊萨酵母、酿酒酵母.本研究首次对帕米尔高原地区传统发酵乳制品中微生物资源进行分析,其结果可为该地区发酵乳制品的研究提供参考.需要进一步更系统的的深入研究挖掘.
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