换一批副干酪乳酪杆菌ProSci-92全基因组分析及胞外多糖生物合成
Whole Genome Analysis and Extracellular Polysaccharide Biosynthesis of Lacticaseibacillus paracasei ProSci-92
摘要乳酸菌(LAB)生产的胞外多糖是微生物适应环境的产物,具有抑制致病菌生长、抗氧化、降血糖等多种益生功效,还具有改善发酵乳制品口感、质构、风味等作用.本研究以从香格里拉藏区酸牦牛乳中分离得到的高产胞外多糖的副干酪乳酪杆菌ProSci-92为研究对象,采用Illumina Hiseq 4000二代测序技术,完成该菌株的全基因组测序,并利用SOAPdenovo软件对其进行组装,结合RAST、COG、GO、KEGG数据库完成基因的预测及功能注释,发现副干酪乳酪杆菌ProSci-92基因组全长3 012 314 bp,共编码2 975个基因.基因注释的结果表明副干酪乳酪杆菌ProSci-92具有完整的eps基因簇,长度为 16 581 bp,包括 wzb、LytR、wzg、epsC、epsD、glf1、glf2、glf3、wze、glf4、WelA、WelB 等 19 个与胞外多糖(EPS)生物合成相关基因.此外,实时荧光定量PCR(RT-qPCR)试验结果证明eps基因簇中几乎所有的基因均可表达,且在6 h时表达量达到最大值.研究结果将有助于副干酪乳酪杆菌ProSci-92 EPS的结构研究,为其工业化应用奠定理论基础.
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关键词
胞外多糖副干酪乳酪杆菌eps基因簇实时荧光定量PCR(RT-qPCR)extracellular polysaccharideLactobacillus paracaseieps gene clusterreal-time fluorescence quantitative PCR(RT-qPCR)
栏目名称
DOI
10.16429/j.1009-7848.2025.02.033
发布时间
2025-05-09（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
内蒙古自治区自然科学基金项目（2024LHMS03035）
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